Integracja z systemem płatności PayU umożliwia wykonywanie płatności przez pacjentów w formie online. Wystarczy wysłać pacjentowi link do płatności w wiadomości email lub SMS. Pacjent po kliknięciu w link przekierowywany jest do okna zapłaty za usługę. Medfile umożliwia na bieżąco weryfikację statusu płatności.